Notesを起動する時に、タスクバーのスタートボタンをクリックして、そこにデフォルトで出てくる「Lotus Notes」のアイコンをクリックしてますか？ インターネットオプションのプログラムの電子メールを「Lotus Notes」にしているとそうなりますので、他のメールシステムにするか、nlnotes.exeのショートカットを作って、それから起動するとかすると大丈夫です。